王琦同志致力于智能运输和信号控制研究，参与国家自然科学基金项目1项，国家重点研发计划项目2项，中国城市轨道交通协会重点科研专项1项，发表学术论文10篇，其中以第一作者发表SCI3篇、EI3篇，参编专著1本，多次参加国内外控制领域顶级会议并作学术报告。     取得多项创新成果：开展了多智能体协同控制研究，建立一致性控制方法与算法；开展了区域轨道交通协同运输研究，构建了总体架构，从规划层、管理层、执行层对区域轨道交通多制式构建的复合网络的协同运输提供依据和指导并以应用系统予以展现；开展了列控系统间隔优化研究；参与设计了轨道交通机电一体化系统方案，率先应用于凤凰磁浮，已投入运营。